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新品推薦:PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液

發(fā)布時間: 2015-09-25

日期:2015-09-25??????????來源:Thermo Fisher 官網(wǎng)

新品推薦:PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液?

適用于所有qPCR儀器的通用型預(yù)混液

PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液的特性包括:

  1. 特異性強:雙重?zé)釂訖C制提供了出眾的特異性

  2. 重復(fù)性高:在較寬的動態(tài)范圍內(nèi)都能獲得可重復(fù)性的Ct值

  3. 靈活性高:適用于標(biāo)準(zhǔn)或快速循環(huán),50分鐘內(nèi)即可獲得結(jié)果

  4. 抗污染能力強:采用UNG和 dUTP配方,可防止殘留PCR產(chǎn)物污染

  5. 穩(wěn)定性高:制備好qPCR反應(yīng)板后,可以在室溫下穩(wěn)定保存72小時

  6. 通用性強:廣泛適用于市面上的儀器

為最大限度保證特異性和可重復(fù)性而配制

PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液含有我們Dual-Lock? Taq DNA聚合酶,后者結(jié)合了兩種熱啟動機制來控制自身的活性。這種雙重?zé)釂油緩娇梢詫aq的活化進行嚴(yán)格的控制,有助于防止聚合酶在低溫下出現(xiàn)不需要的過早活化,從而避免非特異性擴增。Dual-Lock? Taq 配制成了方便的2X預(yù)混液形式,其中含有一套經(jīng)優(yōu)化的緩沖體系、添加劑以及除垢劑成分,可以進一步提升PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液的特異性.

在采用PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液評估24種不同的引物組時,無需進行引物優(yōu)化或重新設(shè)計引物,即可通過100%反應(yīng)獲得單一熔解曲線。相反,在采用幾家競爭廠商的預(yù)混液時,在分析一些相同的靶標(biāo)時,出現(xiàn)了非特異性擴增,如圖所示,熔解曲線之中出現(xiàn)了多個峰(圖1)。SYBR?反應(yīng)的特異性驗證是保證數(shù)據(jù)質(zhì)量和有效性(Bustin et al; 2009)的必要步驟。PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液具有高度特異性,使您可以縮減為獲得優(yōu)質(zhì)數(shù)據(jù)而投入在優(yōu)化和重新設(shè)計引物方面的時間和經(jīng)費.

可重復(fù)性是衡量實時定量PCR數(shù)據(jù)質(zhì)量的另一指標(biāo),而可重復(fù)性經(jīng)常會在低模板濃度時出現(xiàn)下降,而這又會加劇影響數(shù)據(jù)波動。但在采用一系列檢測靶標(biāo)進行測試時,采用雙重?zé)釂覶aq DNA聚合酶的PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液在較寬的動態(tài)范圍內(nèi)展現(xiàn)出了良好的可重復(fù)性(圖2)。其良好的可重復(fù)性使您在分析低豐度轉(zhuǎn)錄本和較小的倍數(shù)變化時,獲得更具意義的結(jié)果.??

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圖1:?在QuantStudio? 7儀器上采用5種不同的預(yù)混液對3種靶標(biāo)進行熔解曲線分析。我們針對每種預(yù)混液采用了廠商推薦的反應(yīng)條件,分別選用了6 個對數(shù)級稀釋倍比的人通用參照cDNA進行分析.競爭廠商B:?BioRad (SsoAdvanced?Universal SYBR? Green Supermix);?競爭廠商R:?Roche (LightCycler? 480 SYBR? Green I Master);?競爭廠商QB:?Quanta Bioscenices (PerfeCTA? SYBR? Green SuperMix );?競爭廠商Q:?Qiagen (QuantiTect SYBR? Green PCR Kit).


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圖2:?在7900儀器上,選取300 nM的兩批PowerUp? SYBR?預(yù)混液進行了24次四重。繪制相對于平均Ct的Ct標(biāo)準(zhǔn)偏差。平均Ct>34的情況被本次分析排除在外。


可在較寬的動態(tài)范圍內(nèi)獲得可靠的結(jié)果

PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液可使100 ng - 0.1 pg cDNA/次反應(yīng)的實驗獲得穩(wěn)定、可靠的結(jié)果。1能在較寬的動態(tài)范圍內(nèi)獲得一致的擴增,是qPCR方法及使用ΔΔCt方法進行基因表達分析的基本前提。與其他競爭產(chǎn)品不同,在動態(tài)范圍實驗中,PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液未在高cDNA起始量、低相關(guān)系數(shù)下出現(xiàn)抑制現(xiàn)象,在6個對數(shù)級的起始樣品量下均維持了穩(wěn)定的效率,最大限度確保了數(shù)據(jù)質(zhì)量的可信度(圖3,表1).

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圖 3:? PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液在較寬的動態(tài)范圍內(nèi)表現(xiàn)出了可靠的性能 我們分別選用6個對數(shù)級稀釋的人通用參照cDNA,獲得了PGK1基因的擴增曲線。反應(yīng)在QuantStudio? 7儀器上依照制造商推薦的實驗流程分三次進行。競爭廠商的預(yù)混液表現(xiàn)出了更高的抑制性,
具體證據(jù)在曲線形狀中可以看出,最高cDNA起始量時的稀釋點間的間距較小。此外,還有幾家競爭廠商的預(yù)混液無法在最低稀釋點檢測到可靠的結(jié)果.競爭廠商 B1:?BioRad (SsoAdvanced?Universal SYBR? Green Supermix);競爭廠商 B2:?SsoFast? EvaGreen? SuperMix;?競爭廠商R:?Roche(LightCycler? 480 SYBR? Green I Master);?競爭廠商 QB:?QuantaBioscenices(PerfeCTA? SYBR? Green SuperMix );?競爭廠商 Q:Qiagen(QuantiTect SYBR? Green PCRKit).


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表1.?競爭廠商的預(yù)混液的4項檢測的動態(tài)范圍比較。表中的數(shù)字表示10倍稀釋的線性范圍,此項指標(biāo)根據(jù)每一種預(yù)混液的各個靶標(biāo)測得。例如,6表示跨越了7次10倍稀釋的范圍,在10uL的反應(yīng)體系中cDNA的濃度從100ng稀釋到了0.1pg.

廣泛的儀器兼容性

PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液可在標(biāo)準(zhǔn)及快速PCR模式下使用,其兼容所有Applied Biosystems? 實時定量PCR儀器。2 此外,還可兼容Bio-Rad IQ?5、Roche LightCycler? 480和Agilent Mx3005P?系統(tǒng)。為確保獲得最佳的結(jié)果,建議的引物濃度應(yīng)介于300–800 nM之間.

2?為確保最佳的實驗性能,建議采用僅適用于Applied Biosystems? 7900系統(tǒng)的標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)條件.

持續(xù)72小時的預(yù)混反應(yīng)穩(wěn)定性

在至多72小時內(nèi),PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液及其Dual-Lock?Taq DNA聚合酶表現(xiàn)出了一致的預(yù)混反應(yīng)性能(表2)。此預(yù)混液的穩(wěn)定性使得用戶可以在進行PCR反應(yīng)之前靈活地設(shè)置孔板,而不對實驗結(jié)果造成影響.3

3?Pre-PCR穩(wěn)定性不僅受到預(yù)混液影響,還受到分析的靶標(biāo)影響。為確保最佳的可信度,研究人員應(yīng)驗證自身具體靶標(biāo)的穩(wěn)定性曲線.

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表2.?PCR預(yù)混物的穩(wěn)定性。使用PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液在StepOnePlus?實時定量PCR系統(tǒng)上從1ng人cDNA中擴增幾種靶標(biāo),分別選擇反應(yīng)設(shè)置后立即擴增或室溫避光72小時后擴增。在0小時和72小時兩個時間點都可以得到單一熔解曲線.


用于遺留污染控制的尿嘧啶-N-糖基化酶(UNG)

在實驗室中,操作常規(guī)PCR時所存在的污染是令很多研究者頭疼的問題,同時也是假陽性結(jié)果的一大重要來源。PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液含有UNG和dUTP,能夠降解任何之前擴增的PCR產(chǎn)物,以免其污染之后的qPCR反應(yīng)。PowerUp? SYBR? Green預(yù)混液使用熱不穩(wěn)定性的UNG酶,能夠有效地控制污染物,同時又不影響后續(xù)的PCR產(chǎn)物下游分析,如熔解曲線或凝膠分析.













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